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中新网西安7月21日电 (阿琳娜 李晓春)记者21日从西北农林科技大学获悉,该校国家肉牛改良中心主任昝林森教授团队联合北京康普森农业科技有限公司,成功研发出“中国黄牛1号”50K育种芯片,并于近日正式对外发布。该液相芯片是团队继2021年1月成功开发首款中国黄牛高密度SNPs固相芯片、打破肉牛育种芯片国际垄断后,在牛分子育种技术领域取得的又一重大突破。
中国是全球牛种质资源最丰富的国家之一,拥有58个地方黄牛品种,形成耐粗饲、抗逆性强、适应性广、肉质好等优点突出的遗传多样性谱系,但与国外专门化肉牛品种相比,中国黄牛生长速度较慢、后躯欠发达、产肉量较低等不足影响了其肉用开发利用。
传统的育种方法依赖表型观察和经验判断,效率低、周期长,难以准确捕捉基因层面的优良性状。因此,加强中国地方黄牛保护选育和高效利用,培育具有特色优异性状的自主品牌肉牛良种,以提升产业核心竞争力,迫在眉睫。
近五年来,昝林森教授团队运用生物信息学,对以秦川牛为代表的分布于中国西北、华东、华中、华南、西南、东北等6个地理区系的地方黄牛品种特异性位点进行精准筛选,并整合多年来在生长、肉质、繁殖及抗病等性状相关功能位点的研究成果,成功研发“中国黄牛1号”50K育种芯片,该芯片具有检测成本低、选择准确性高等特点,实现中国黄牛快速、精准、高效选育,为地方黄牛品种保护、定向选育和高效利用提供了强有力技术支撑,也为中国肉牛种业高质量发展注入了新的动力。
据介绍,该芯片以中国五大良种黄牛为主,涵盖中国6个地理区系38个黄牛品种基因组重测序数据,同时包含生长、肉质、繁殖及抗病等多个关键性状相关功能位点18500个,为精准育种提供了科学依据。同时,在38个中国黄牛品种近30T基因组重测序数据分析基础上,芯片为上述黄牛品种量身定制了专属的鉴定位点,能够精准识别其独特的基因标识,为中国黄牛种鉴定与保护提供了有力支撑。
利用该芯片分别对秦川牛、南阳牛、鲁西牛和延边牛四个品种共计28个个体进行了SNP位点检测,对存在地理差异的10个品种共47个个体进行检测,结果表明“中国黄牛1号”50k育种芯片位点选择合适、芯片设计合理,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。(完)
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